A Comissão Própria de Avaliação (CPA) da FAE foi constituída em 10 de setembro de 2004 e alterada em 23 de novembro de 2007, pela Portaria GR N.º 21/2007.

Essa Comissão é responsável pela condução dos processos de avaliação interna, pela sistematização e pela prestação de informações solicitadas pela CONAES/MEC.

A CPA/FAE tem atuação autônoma em relação aos conselhos e demais órgãos colegiados existentes na Instituição.